Malgré un nombre important d’opérations menées dans le premier contrat de rivière 1996-2001, l’activité humaine impacte encore d’une façon non négligeable la qualité des eaux des rivières essentiellement en période de basses eaux.
Le parc de stations d’épuration à été renouvelé durant la période couverte par le premier contrat de rivière, des pressions liées aux rejets domestiques existent encore sur des petites stations sous-dimensionnées ou obsolètes ou encore sur des réseaux défectueux.
Vingt pour cent de la population n’est pas raccordé au réseau public mais certaines maisons ne possèdent pas de systèmes d’assainissement autonomes aux normes.